软件工厂和敏捷开发是两种不同的软件开发方法论，它们的关系是互补的。

软件工厂注重标准化、自动化和系统化的软件开发过程，以提高软件开发效率和质量。它通常适用于大型软件开发项目，需要预先规划和制定完整的开发计划，并按照计划执行开发工作。这种方式在一些场景下可以带来较好的效果，但是需要消耗大量的时间和人力资源，且可能过于僵化，难以应对变化。

敏捷开发则注重灵活性和快速响应变化，强调快速交付和持续反馈。敏捷开发通常采用迭代和增量的方式进行开发，每个迭代都会交付部分功能，并在后续迭代中进行不断迭代和优化。敏捷开发可以适应变化和不确定性，可以提高团队的协作效率，但也需要团队成员具备较高的技能和开发经验。

在实际软件开发中，软件工厂和敏捷开发可以结合使用。例如，软件工厂可以使用敏捷开发中的迭代和增量方式，将大型开发项目拆分成多个小的迭代周期，每个迭代都交付部分功能，并根据反馈进行迭代和优化。这样既可以提高效率和质量，又可以保持灵活性和快速响应变化。

将软件工厂和敏捷开发结合使用的具体方法可以根据具体项目情况而异。下面是一些可能的建议：

1. 划分迭代周期：将整个软件开发过程划分成多个迭代周期，每个周期持续时间为1-4周。每个迭代周期结束时，需要完成一个或多个可交付的软件功能模块。

2. 制定迭代计划：每个迭代周期开始前，制定一个迭代计划，包括需求分析、设计、编码、测试、验收等工作任务。每个任务的完成时间和负责人应明确，任务的进度应及时更新。

3. 定期迭代评审：每个迭代周期结束后，进行迭代评审，总结前一迭代周期的经验和教训，对下一迭代计划进行调整和优化。
   

4. 持续集成和交付：使用自动化工具和技术，实现持续集成和交付。每个代码提交都需要进行自动化测试和代码审查，确保代码质量和稳定性。每个迭代周期结束时，自动化构建和部署软件，交付可用的软件版本。
   

5. 紧密合作和沟通：软件工厂和敏捷开发需要紧密合作和沟通，形成一个高效的团队。需要定期开会和交流，及时解决问题和风险，并共同制定和更新开发计划。
   

总之，将软件工厂和敏捷开发结合使用，可以兼顾效率和质量，同时保持灵活性和快速响应变化。但是具体实现需要根据项目情况而定，需要团队成员具备较高的技能和经验。